In September 1996 werd begonnen met de produktie van de Octavia, een geheel nieuwe middenklasser. De Octavia Combi werd geïntroduceerd in 1998.
De opvolger van de Felicia werd in 1999 de Škoda Fabia. In eerste instantie werd de Fabia geleverd met een 1.4 MPI/50 kW, een 1.4/74 kW of een 1.9 SDI/47 kW motor. Tegenwoordig is het aanbod van motoren veel uitgebreider.
Tussen 1997 en 200 werden meer dan 4000 Felicia Fun´s geproduceerd. De Felicia Fun was gebaseerd op de Felicia pick-up en speciaal ontwikkeld voor de vrije tijd.